Fedora kao i mnoge druge distribucije ne traži po default-u deljene biblioteke u /usr/local/lib direktorijumu. Imaš bar četiri rešenja za tvoj problem.
1. Već pomenuto (ne preporučujem)
2. Deinstaliraš tag biblioteku i instaliraš u /usr (./configure –prefix=’/usr’)
3. U /etc/ld.so.conf dodaš red /usr/local/lib, i pokreneš jednom ldconfig za svaki slučaj, čime ujedno rešavaš i sve buduće instalacije u /usr/local. Ovo je standardno rešenje i ja ga preporučujem.
4. Napraviš promenljivu okruženja LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib (ne preporučujem)
Ovde se pretpostavlja da nemaš problema sa pkg-config -om.
BTW zbog čega je loše mešati source biblioteke sa rpm-om? Kakve veze ima kako je instalirana koja biblioteka(osim pri deinstalaciji)?